Das Fakip bietet seit über einem Jahrzehnt die staatlich anerkannte, postgraduale Ausbildung in Kinder- und Jugendlichenpsychotherapie mit dem Schwerpunkt Verhaltenstherapie an. Gleichzeitig bieten wir in unserer Institutsambulanz im Rahmen der Ausbildung eine verhaltenstherapeutische Behandlung für Kinder und Jugendliche an. Damit leistet das Fakip neben der Ausbildungsarbeit einen wichtigen Beitrag zur verhaltenstherapeutischen Versorgung von Kindern und Jugendlichen im Raum Freiburg.

Das Fakip ist dabei an die Albert-Ludwigs-Universität Freiburg und insbesondere an die Abteilung für Klinische Psychologie und Psychotherapie (am Institut für Psychologie) von Prof. Dr. Brunna Tuschen-Caffier angebunden, die seit der Gründung im Jahr 2010 die Vorsitzende der Institutsleitung sowie Geschäftsführerin ist. Durch diese institutionelle Kooperation ist sichergestellt, dass die Psychotherapie evidenzbasiert und am aktuellen Stand der wissenschaftlichen Forschung orientiert ist.   Das Fakip ist zudem aktives Mitglied bei >unith<, dem Verbund der universitären Ausbildungsgänge für Psychotherapie. Als gemeinnütziger eingetragener Verein hat sich >unith< zum Ziel gesetzt, durch eine enge Verknüpfung von staatlich anerkannter Psychotherapieausbildung und akademischer Forschung  eine hohe Qualität und Aktualität in der Ausbildung von Psychotherapeutinnen und Psychotherapeuten zu sichern.
Ein enger Kooperationspartner ist zudem das Freiburger Ausbildungsinstitut für Verhaltenstherapie (FAVT), das ebenfalls an der Albert-Ludwigs-Universität Freiburg angegliedert ist und ein vergleichbares Angebot für Erwachsene anbietet.